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菠蘿蛋白酶是從鳳梨屬植物-菠蘿中經生物工程技術提取精制而成的一組巰基水解蛋白酶，其分子量為33000，等電點為9.55。菠蘿蛋白酶主要來源于植物莖中，故也稱為莖菠蘿蛋白酶。菠蘿蛋白酶的主要成分是一種含巰基的蛋白酶，同時還包含過氧化物酶、酸性磷酸酯酶、幾種蛋白抑制劑和有機活性鈣，其活性中心為巰基（—SH），能進行各種蛋白質水解，進行生化反應，可廣泛應用于食品、醫藥及生物等行業。

 菠蘿蛋白酶又稱菠蘿酶。由菠蘿汁、皮等提取的巰基蛋白酶。淺黃色無定形粉末，微有特異臭。分子量33000。對酪蛋白、血紅蛋白、BAEE的最適pH值是6～8，對明膠是pH值5.0。酶活性受重金屬抑制。略溶于水，不溶于乙醇、丙酮、氯仿和乙醚。它優先水解堿性氨基酸(例如精氨酸)或芳香族氨基酸(例如苯丙氨酸、酪氨酸)的羧基側上的肽鏈，選擇性水解纖維蛋白，可分解肌纖維，而對纖維蛋白原作用微弱。可用于啤酒澄清。